El Observatorio Regional cuenta con un Consejo Directivo, máximo órgano de dirección y ejecución; integrado por los representantes de alto nivel de las siguientes instituciones:

1. Gerencia Regional de Desarrollo Social
2. Programa Aurora
3. Policía Nacional del Perú
4. Dirección Regional de Salud
5. Ministerio Público de la Región
6. Poder Judicial de la Región